Budowę kościoła rozpoczęto w czerwcu 2012 roku. Trzy lata później, 5 września 2015 r. dokonano uroczystego wmurowania kamienia węgielnego wyjętego z fundamentów pierwszej Bazyliki Św. Piotra w Watykanie. Świątynia pw. Maryi Gwiazdy Nowej Ewangelizacji i św. Jana Pawła II jest wotum wdzięczności za pontyfikat Jana Pawła II. W prezbiterium świątyni znajduje się kopia watykańskiej kaplicy papieży w skali 1:1. Umieszczono tutaj obraz Matki Bożej Częstochowskiej, przed którym modlił się przez lata swego pontyfikatu św. Jan Paweł II. W dolnej części świątyni jest Kaplica Pamięci poświęcona męczennikom. Na jej ścianach są wypisane nazwiska Polaków zamordowanych za pomoc ludności żydowskiej oraz relikwie polskich męczenników. W centrum kaplicy jest figura Matki Bożej Niepokalanej.
Anna Ben Ezra Attaché ds. Kultury Ambasady Izraela w Polsce podziękowała za Kaplicę Pamięci w Toruniu, w której upamiętnieni są Polacy ratujący ludność żydowską. Podkreśliła, że misją ambasady jest uhonorowanie tych, którzy byli zaangażowani w pomoc Żydom, dlatego z radością i szacunkiem przyjęła inicjatywę powstania Kaplicy Pamięci. Reprezentantka Ambasady Izraela wyraziła wdzięczność za życie i posługę św. Jana Pawła II, który był orędownikiem dialogu katolicko-żydowskiego.
Specjalny list nadesłał Przewodniczący Konferencji Episkopatu Polski, abp Stanisław Gądecki, w którym napisał: - Konsekracja świątyni pw. Maryi Gwiazdy Nowej Ewangelizacji – w tak szczególnym roku – Nadzwyczajnego Jubileuszu Miłosierdzia, Jubileuszu 1050-lecia Chrztu Polski oraz Światowych Dni Młodzieży jest szczególnym znakiem.
W uroczystej Mszy Świętej celebrowanej przez ok. 400 kapłanów oraz ok. 40 biskupów uczestniczyło tysiące pielgrzymów z Polski i z zagranicy.
Zobacz także: Życzenia Przewodniczącego KEP z okazji konsekracji świątyni pw. Maryi Gwiazdy Nowej Ewangelizacji i św. Jana Pawła II