Duszpasterstwo Krajowe Ruchu Pomocników Matki Kościoła (pięcioosobowy Zarząd Ruchu, któremu przewodniczy duszpasterz krajowy PMK), zgodnie ze Statutem Ruchu, koordynuje działalność Ruchu Pomocników Matki Kościoła na forum ogólnopolskim: organizuje doroczną pielgrzymkę członków Ruchu na Jasną Górę, rekolekcje kapłańskie dla duszpasterzy diecezjalnych Ruchu, wielkopostne dni skupienia dla animatorów Ruchu. Duszpasterstwo Krajowe przygotowuje materiały formacyjne dla członków Ruchu. Duszpasterstwo Krajowe PMK opracowuje także odpowiednie materiały dotyczące konstytutywnego dla Ruchu Aktu oddania Matce Bożej, jak również materiały przybliżające postać i nauczanie pasterskie założyciela Ruchu bł. kard. Stefana Wyszyńskiego.